许多新兴企业也应运而生，如第一家售卖各类新兴货品如肥皂香皂等的百货公司和第一家专门为普通百姓进行快递服务的邮递公司也都相继出现。
这些都是因为商品多样化和贸易交流太过频繁后而朝廷皇家资本又无暇顾及后出现的产物，朱由校并没有阻止民间自发的出现这种商业方式，甚至他鼓励一些聪明而有远见卓识的人因此而一夜暴富，有时候朱由校还会指示官方报刊对这类商界传奇人物的财富故事进行宣传，以达到激发所有人创造财富和创新的积极性。
当然，这一切幕后也离不了皇家银行这个推手，其实现在皇家银行很多业务已经转移到了新成立的皇家农业、交通、工商各类银行，但真正大明经济的幕后推手还是皇家银行，他作为大明的央行，一手抓着银元的铸币权一手抓着大明绝大部分财富如几大皇家资本的收入与国库税收，使得他能随时控制大明的经济，当然他也是朱由校掌控大明乃至掌控禁卫军最重要的一张牌。
随着生产力发展和生产方式改变导致经济的越来越繁荣和各种新兴行业和新的投资方式的不断涌现后，大明朝廷的行政体系也开始出现无法支应的现象。
以前的大明朝廷只是一个由朱元璋建立然后充当一个维持小农经济稳定的中央集权政体，他更多的功能是在对小农经济的条件和支持还有为朱氏家族乃至于其他统治者占据更多生产资料，其服务性是相对较少的，但现在需要朝廷提供社会公共服务与宏观调控的地方越来越多，也就使得大明现在的行政体系已经开始渐渐的无法支持整个大明的发展。
朱由校也在想是不是要改革一下行政体系，特别是六部是不是要进一步扩充，比如现在的户部是不是要直接分成财政、民政、商务、审计、国土资源等部，因为现在户部实在涵盖的功能实在是太多了，朱由校任命的户部侍郎已经不下六位，官职重叠性太高，而一个户部尚书权力已然太大，因为他几乎就控制了大明所有的经济脉门，搁在现代就相当于于一个副总0理了。
不仅仅是户部，即便是礼部现在也是后世教育、外交、文化等后世好几个大部门的杂糅。
如实搁在以前小农经济为主体时代，由于社会主要生产方式就只有农业，其他行业并不很发达，整个国家的行政体系倒能运转。
但现在，光是在教育方面，因为朱由校要求在未来五年普及到每一个大明孩童都能上学五年的旨意都能让礼部无法完成，因为一个礼部还得忙着科举与各种新兴报刊的审核等事务。
