国防部。陆、海、空军三军种部划归其下；参联会设主席一职，各军种还保留“作战指挥权”和“行政独立”。
后来制定的《国防改组法》使国防部长掌握了作战指挥权，在财会、科研、后勤等方面均有更大实权。
在美丽国，国防部长是军队的最高行政长官，所以各军兵种的首长，如陆军参谋长，海军作战部长，空军参谋长，海军陆战队司令都要受他管理。虽然没有军衔，但是所有的现役军人都要叫他长官。
当然，对于军事方面的决策权并不会掌握在国防部长手中，而是由总统掌握，指挥权则是在参谋长联席会议手里。
虽然如此，国防部长依旧是美丽国军方掌握巨大权利的一个重要人物，而约翰·凯勒就是这个人。
在新任的总统和高层更换了一批之后，约翰·凯勒从临时总统的位置上退了下来，作为交换条件，他依旧担任国防部长这个重要的职务。
作为一个担任国防部长多年的高管，约翰·凯勒除了不知道那个胡佛创建的秘密第七区之外，掌握着美丽国军方的所有事物。
关于赛博坦星人入侵之事，约翰·凯勒看似将所有事务的决定都交给了总统决策，可实际上他也一直在筹谋反击策略。
战争说到底就是考验敌我双方兵力和战斗力的游戏，人类的军事力量却在这场游戏中变成了毫无存在感的一员，所以如何增强己方的战力就是这段时间约翰·凯勒部长主抓的事情。
