圣上大为震惊，问道:“今天作乱的人是谁呀？你来到这里做什么？”
尉迟恭回答说:“秦王因太子、齐王作乱，起兵把他们诛杀了，恐怕惊动陛下，派遣我来护卫。”
圣上大吃一惊地对裴寂等人说:“不料今天竟会有这样的事，应当怎么办？”
裴寂、萧瑀、封德彝等宰相们见大势已去，于是纷纷见风使舵纷纷表态说:“李建成、李元吉本来就没有参与太原首义，对天下没有建立功劳，疾恨秦王功劳大、声望重，共同陷害秦王。如今秦王已经讨诛杀了他们，秦王功盖天下，天下归心，圣上假若让秦王做太子，把国家大事委托给他，不会再有事端发生了!”
圣上看到事已至此无法挽回，就只好说:“甚好！这也是朕平生所愿。”
这时，秦王府卫队和太子党徒们交战还没有停止，尉迟恭请求圣上下道敕令，命令各军一并接受秦王的处置，圣上无奈听从了，派裴矩、宇文士及从东上阁门出来，宣布圣上的敕令，交战的士兵们才停止战斗散去，玄武门之变以秦王的险胜而告终。
这时，秦王李世民来太极宫海池觐见圣上。
圣上见到秦王感叹说:“今日，朕几乎有了像当年曾母误听人说曾参杀人而抛开织布梭逾墙逃走的迷惑。”
秦王李世民跪着伏在圣上胸前，像小孩吮乳一样，号啕恸哭很久。
六月初七，圣上下诏命立李世民为皇太子。诏书上说:“从今以后，军队国家各种事务，无论大小，都委任太子来处理决断，然后听闻奏报。”
六月十二日，已是太子的李世民开始权力大洗牌，下太子令：
“裴寂为中书令，萧瑀为尚书左仆射，封德彝为尚书右仆射，宇文士及为中书左侍郎，原任不变。
任命：长孙无忌为吏部尚书，高士廉为门下省侍中，房玄龄为中书右侍郎，杜如晦为户部尚书。
任命：秦叔宝为左卫大将军，程咬金为右卫大将军，尉迟恭为右侯大将军，侯君集为左卫将军，段志玄为骁卫将军，张公谨为右武侯将军，常何为右武卫将军。
从嶲州召回被流放的王珪、韦挺、杜淹，任命为御史大夫。”
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