士贵等发动玄武门政变,伏杀太子李建成、齐王李元吉。李渊立李世民为皇太子,玄武门之变后,李世民担心洛阳发生动乱,派屈突通驰赴洛阳,以检校行台仆射之职镇守洛阳。李渊退位,李世民即皇帝位,大封功臣,屈突通因功赐封食邑六百户。
屈突通病逝,享年七十二岁,唐太宗痛惜良久,赠予尚书右仆射,谥忠。屈突通有二子:屈突寿、屈突诠,屈突寿袭爵。后唐太宗至洛阳,想起屈突通的忠节之事,拜屈突诠为果毅都尉,并赐予粮食布帛表示抚恤,屈突诠后官至瀛州刺史。唐太宗命人画二十四功臣图于凌烟阁,皆真人大小,屈突通名列其中,位于第十二名,与房玄龄配列太宗庙庭。
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