队与叛军联合，于是起用郭子仪为朔方、河中、北庭、潞、仪、泽、沁等州节度行营，兼兴平、定国等军兵马副元帅，进封汾阳郡王，驻守绛州。
唐肃宗病重，不见百官，郭子仪请求道：“老臣接受任命，将要死在外地，不见到陛下，死也不能瞑目。”肃宗命人将其请入卧室，道：“河东的事情全都拜托你了。”并赐他御马等物。郭子仪到达治地后，诛杀为首作乱的王元振等几十人，新任河东节度使辛云京也处死作乱者，各地将领尽皆恐惧，不再敢作乱。
唐代宗能即位，宦官程元振自认为有拥立之功，担心老将难以制服，多次离间诬陷。郭子仪被罢免副元帅之职，而加实户七百，再失兵权，充任肃宗山陵使，督建皇陵。郭子仪将肃宗所赐的诏书一千余件全部呈给代宗，以表明自己的忠心，代宗看后，安慰郭子仪道：“使重臣忧虑，我很惭愧，从今后您不要担心。”此时，史朝义仍占据洛阳，代宗欲派郭子仪与雍王李适率军东征，由于鱼朝恩、程元振的谗言，代宗最终放弃了这个打算。
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吐蕃入寇，而程元振隐瞒军情不报，由于之前唐代宗猜忌将领，兵部尚书、同平章事来瑱被谗杀，导致长安几乎没有军队防御。镇守徐州的太尉兼侍中、河南副元帅李光弼因为畏惧谗言不敢带兵入朝救援，襄州刺史、山南东道节度使、同平章事梁崇义在襄州反叛，而驻扎在汾州的河北副元帅、朔方节度使仆固怀恩更是暗中召回纥、吐蕃入侵河西，侵寇泾州，进犯奉天、武功。唐代宗不得已，遂起用雍王李适为关内元帅，郭子仪为关内副元帅，镇守咸阳。
郭子仪自从被罢回京师，他的部曲离散，等到接受诏书为关内副元帅时，郭子仪麾下只有20个骑兵。郭子仪刚到咸阳，吐蕃军已经过渭水，沿着南山东进，郭子仪使王延昌入奏，请给自己增加军队，但是被程元振阻止，不让皇帝见郭子仪、王延昌。等到唐代宗开始治兵时，吐蕃军已过便桥，唐代宗仓促间不知所措，后来唐代宗逃往陕州，官员藏匿、军队逃散。郭子仪听闻后，急忙从咸阳回长安，达到长安后，唐代宗已离开了，唐代宗刚出苑门、渡过浐水，射生将王献忠率四百骑兵叛逃回长安，胁迫丰王李珙等十王向西迎接吐蕃。在开远门遇上郭子仪，郭子仪呵斥王献忠，王献忠下马说：“现在皇帝东逃，国家无主，你身为元帅，废立就在你一句话”。郭子仪没有回应，李珙接着说：“你为什么不说话”。郭子仪责备他，然后派兵将宗室诸王护送到唐代宗那里。
吐蕃进入长安，长安很多官员、百姓逃进山谷，郭子仪率三千骑兵从御宿川沿着山向东走，郭子仪跟王延昌说：“将士大多逃去了商州，现在赶快去召集，并调发武关的关防兵，数日间，向北出蓝田奔赴长安，吐蕃必定逃去”。郭子仪到了蓝田，遇到元帅都虞候臧希让、凤翔节度使高升，得到士兵将近千人，郭子仪与王延昌商量说：“逃散的士兵到商州，官吏必定逃走躲藏起来”。派王延昌直接入商州安抚。正当众将士放纵士兵掠夺时，听闻郭子仪到了，都大喜并表示听郭子仪号令。
郭子仪担心吐蕃攻击唐代宗，就先留下守卫七盘关，三日后才出发去商州，到了商州后收集士兵，合并武关防兵共四千人，官军势力稍微振作起来。此时宝应军使张知节在洛南迎接郭子仪，大阅兵，屯驻商州，威震关中。郭子仪于是流着泪告诉诸位将士要雪国耻，光复长安，众将士都感动并受郭子仪节度。郭子仪任命太子宾客第五琦为粮料使，供给粮食。唐代宗给郭子仪下诏，表示担心吐蕃东出潼关，召郭子仪赶赴行在，郭子仪上表说：“臣不光复长安就没有脸面见陛下您，我若出兵蓝天，敌人必不敢向东去。”唐代宗允许了。另外鄜坊节度判官段秀实告诉节度使白孝德一同率军共讨叛军，白孝德当日就带兵出发，向南急速赶赴长安，与蒲、陕、商、华汇合进击。
光禄卿殷仲卿在蓝田募兵，用郭子仪到了商州，还不知道殷仲卿在蓝田募兵，郭子仪派人前去查探敌人的情况。羽林将军长孙全绪请缨，率两百骑兵前往。郭子仪又令太子宾客第五琦代理京兆尹之职务，一同收复长安。郭子仪又令宝应军使张知节率兵继之，长孙全绪等人到了韩公堆，白天击鼓，晚上则放火，使吐蕃起疑，殷仲卿探知官军势力更加强大。于是，与长孙全绪相互配合，把情形报告给郭子仪，殷仲卿率两百骑兵游荡，直接渡过浐水。
吐蕃惊惧，问百姓，百姓欺骗他们说：“郭子仪从商州领兵收复长安，大军不知有多少”，吐蕃认为官军众多，于是率军退走，余众还在城中。军将王抚及御史大夫王仲升率兵从苑中进来
