听说庞师古在清口之战中失败，于是立即回师。
葛从周率领军队攻占山东，当时李克用率领大军驻扎在邢州、洺州，葛从周到巨鹿与晋军交战，大获全胜，李克用逃走，葛从周军追击到青山口，数天之内，接连攻下邢、洺、磁三州，杀晋军两万人，俘虏将帅军官一百五十人，于是又以葛从周兼任邢州留后。又在张公桥打败晋军五千骑兵，晋将李嗣昭急攻邢州，在邢州城外摆起战阵，葛从周大败晋军，抓住蕃将贲金铁、慕容腾等一百多人。
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幽州刘仁恭率领十万燕军进犯魏州，屠戮贝州人民，葛从周从邢台奔赴魏州，幽州军队突破上水关，进攻馆陶门，葛从周与贺德伦率领五百骑兵出战，对守卫馆陶门的兵士说：“前有强敌，我们不会再活着回来了！”命令守门兵士在他们身后关上馆陶门。葛从周等五百壮士破釜沉舟与燕军进行殊死决战，大败燕军，活捉了都将薛突厥、王郐郎等人。第二天，攻破燕军八座营寨，一直追击到临清，刘仁恭逃奔沧州，葛从周任宣义军行军司马，晋军讨伐潞州的李罕之，朱温派丁会代替李罕之，命令葛从周奔赴上党。
晋军攻陷泽州，朱温召回葛从周，命令贺德伦守卫潞州，贺德伦等旋即放弃潞州州城而回。葛从周率领部队攻打沧州，先进攻德州，攻下了它。到进攻浮阳时，幽州刘仁恭率领大军前来救援，这时都监蒋玄晖对诸位将领们说：“主君命令我监护军队，目的在于攻击占领，现在燕军统帅赶来救援浮阳，我们不能在城外与他们进行野战，而应当把他们放进浮阳城，让他们一起分食仓库仅有的粮食，当他们的粮食吃完时，必定可以攻下浮阳。”葛从周回答说：“用兵在于掌握时机，掌握时机权在最高将领，并非像蒋都监所说的那样。”于是，命令张存敬、氏叔琮守住他们的营寨。
葛从周在乾宁军老鸦堤迎战燕军，大破燕军，杀死敌人三万，俘获将佐马慎交以下一百多人，夺得战马三千匹。晋军进攻邢州、洺州，葛从周跟随朱温打败他们，葛从周追击直到青山口，杀敌五千人，俘获大将王合郎、杨师悦等人，获得战马一千匹，上表奏明唐昭宗，授葛从周检校太保兼徐州两使留后，旋即任兖州节度使。
葛从周患病时依然领兵打仗，这一次是和有名的智谋之将刘鄩交锋，葛从周也没有败给他，刘鄩最后反而投降了。在朱温去长安一带用兵对付李茂贞时，东面的王师范就趁机派刘鄩攻占了兖州，兖州本是葛从周的辖地，所以朱温命葛从周去击退刘鄩收回兖州。这个刘鄩确实很有智谋，王师范共派了几路人马来进攻朱温的地界，但只有刘鄩取胜攻占了兖州。刘鄩先派奸细扮成卖油的小贩，到兖州城里去侦察虚实。最后看到有一个水洞可以出入。于是就派人从水洞里泅渡而进，就这样攻占了兖州城。
葛从周发兵之后，将兖州城围困起来，但他的母亲和其他家属因为都在兖州城里住，所以被刘鄩俘获。但刘鄩并没有加害他的亲属，而是更加照顾，像对待自己的母亲一样照料葛从周的母亲，等葛从周到了城下，刘鄩就让人将葛从周的母亲搀扶到城墙上，说刘鄩对她很好。葛从周见状左右为难，哭着先收兵回营去了。和众将商议用什么计策攻城，救下母亲和亲属。但都没什么良策，只好继续围困，等待时机。
被围时间一长，城内的百姓和将士有的就想投降归顺。刘鄩将老弱和妇人这些不能一起守城的人放出去，然后自己和将士及百姓坚守兖州城，抵抗葛从周。节度副使王彦温越城投奔葛从周去了，其他将士和一些百姓也纷纷出城投降。守城的士兵也无法阻拦。刘鄩又急中生智，赶忙派人去告诉王彦温，对他说：“请副使少带人出降，不是选派的请别带走。”然后又放言对众人说：“原来派去跟副使一块走的不要阻拦，擅自出去的人就要诛灭全族！”守城的军民听了迷惑不解，但再没有随意出城的了。葛从周的将士听到这些话后，果然认为王彦温投降有诈，没有盘问就将王彦温杀死在城下。这一计使兖州城稳固如初。最后，在王师范败局已定时，葛从周又劝降刘鄩，刘鄩说如果王师范投降，那他也会归顺。王师范投降后，说刘鄩攻占兖州城是他所派，请恕其罪。刘鄩听说后，这才献城投降。葛从周为他准备了行装马匹去首都见朱温，刘鄩却说：“还没有得到梁王恕罪之命，不敢穿锦衣骑骏马。”说完，他就穿着布衣骑着毛驴去见朱温。
刘鄩献城投降后，葛从周因功授检校太傅，由于他有病，朱温便让康怀英代替了他的职务，授予他左金吾上将军，照顾他可以不经常上朝拜见，不久以右卫上将军做
