小天和雷吉奇卡斯，雷希拉姆，基格尔德三只传说宝可梦分开，使用时空晶石来到另一个时间线。
真新镇
穿着青绿色短衣短裤的小智慌慌张张地从家里跑了出来，赤着脚连鞋都没有穿，直奔大木博士的研究所。
“大木博士，我的神奇宝贝！”
一段时间后，小智和一只皮卡丘走出了大木博士的研究所，皮卡丘一副不情愿的样子，小智在一旁围着皮卡丘打转，可是皮卡丘就是不进精灵球。
小天远远地看着小智和皮卡丘松了口气，原来那只皮丘就是现在的皮卡丘，还好改过来了，皮卡丘换成了穿山鼠，这不胡闹吗，想当初小天玩的一款宝可梦游戏，穿山王直接进化成固拉多，当时小天就懵逼了。
那还是小天接触到的第一款宝可梦游戏，真的就懵逼了。
收服的烈焰猴拿回去封印保存一段时间，基格尔德说过，只要短期不把它放出来，奇伽索什尔的影响自动就会消失，奇伽索什尔如果无法继续影响这个世界，它就无法存在，小天掏出时空晶石，消失在了原地。
另一边，樱木研究所。
带着面具的小豪鬼鬼祟祟地进入樱木研究所，来到研究所的内部，宝可梦生活的地方，小豪向前方蹑手蹑脚探去，突然好像撞到什么东西。
然而前方什么都没有，下一刻，隐身的千面避役显现出来，打量着眼前的小豪。
“千面避役！”小豪惊喜道。
“是我啊，我是小豪，千面避役，我带你们走。”小豪揭开面具说道。
千面避役看到小豪略显惊讶，樱木研究所的宝可梦注意到小豪也都探过头来。
“哈哈哈，跟我走吧。”小豪拿出精灵球想要把千面避役收入其中，却被它灵活躲开。
“千面避役？”小豪不可置信地看向它，只见周围小豪的宝可梦也都躲着他。
“你们是怎么了！”小豪一时间觉得众叛亲离。
“宝可梦不是工具，它们也有着自己的思想，它们不再认可你了，小豪。”樱木博士的声音传来，小豪猛然回头，只见樱木博士和研究所的人员走了过来，小春跟在后面，面色复杂地瞥了小豪一眼。
“不认可我了？什么意思。”小豪面色难看道。
“就是字面上的意思！”樱木声音抬高几分严厉道，“小豪，你怎么会变成这个样子，你……”
“你闭嘴！”小豪如同被踩了尾巴似的突然急了。
“我只是为了收服宝可梦，所有的宝可梦！”小豪面色激动，看向四周躲起来的宝可梦，大吼道。
“你们都是我收服的宝可梦，为什么不认可我，都给我过来！”
一片寂静，周围的宝可梦没有动作，胆小的已经躲了起来，显然小豪的样子吓到这些宝可梦了。
“既然这样！”小豪气的牙痒痒，这些宝可梦都是我收服的，现在都不听我说的话了，放屁，放屁。
小豪咬牙切齿地拿出众多精灵球，红光射出，想要把这些宝可梦直接收入精灵球，看你们还怎么躲。
然而当红光射中宝可梦的时候，突然消散开来，宝可梦什么反应也没有。
“怎，怎么会这样。”小豪嘴角一抖，精灵球散落在地上。
“你被警署逮捕的时候，警方已经剥夺了你全部宝可梦的所有权，这些宝可梦已经不是你的了。”樱木说道。
“不，不不。”小豪跪倒在地，一时接受不了，这是他收服的宝可梦，他去收服的，现在，全部没了？不，这些都是我的宝可梦！
小豪面色扭曲，脑子中不断传来疯狂的咆哮声，我的宝可梦没了，我的宝可梦没了，不！小豪只觉得脑子要炸开了。
“小豪，你都干了些什么呀，为什么要加入犯罪组织。”小春忍不住道，没想到她所熟悉的小豪竟然会变成这样。
小豪情绪激动，好像没有听到小春的话，扔出一只精灵球，体型巨大且狰狞的黑鲁加出现。
樱木博士看到这只好似怪物一样的黑鲁加惊讶万分，完全看不出宝可梦的样子。
“既然这样，那就重新收服就行了，恶之波动！”小豪命令道。
黑色的能量波动迸发，直奔樱木博士等人。
“快躲开！”樱木博士护住小春，恶之波动炸响，硝烟弥漫。
小春透过烟尘看着几乎疯狂的小豪，她此刻知道小豪全变了，他现在只是一个危害宝可梦，危害他人十恶不赦的混蛋。
