始皇亲自为他求情。蒙毅迟疑了一下，只得叹息道：“陛下开恩，臣岂敢不从！”
赵高心喜若狂，痛哭流涕，拜谢道：“罪臣感谢陛下再造之恩！”
“不是朕开恩，而是蒙卿法外施恩，饶你一死。”始皇知道蒙毅心里不痛快，便把这个人情送了过去。赵高绝顶聪明，立即给蒙毅磕头说：“罪臣多谢廷尉大人活命之恩。”蒙毅端坐不动，冷冷地说：“郎中令如此大礼，蒙某担当不起，请起来吧！”
卢生、侯公、石生、韩冬等人逃出咸阳之后，过着飘泊不定的逃难生活，对始皇无不恨之入骨。他们本身就是儒生，对始皇的《焚书令》深为不满，卢生还参加过抗议活动。只是当时他们深受始皇的信任，不愿意放弃眼前的荣华富贵。如今既成逃犯，一切都成了泡影，才下定决心与嬴政见个高低。
卢生等人很快参加了抵制《焚书令》的儒生组织，并成了骨干分子。他们利用自己深入朝廷内部的亲身经历，到处揭露朝廷的内幕和始皇暴虐、荒淫的生活。卢生亲书讨伐嬴政的檄文说：嬴政生性残暴，刚愎自用。自从扫平诸侯兼并天下以来，更加狂傲自满，自以为功过三皇、德及五帝，他崇尚严刑峻法、专宠狱吏，虽设立七十名博士，不过是虚应故事，不为所用。国家事无大小都由他决断，丞相和大臣只能遵照执行。嬴政还喜欢以酷刑和杀戮表现他的威权。从朝廷大臣到地方小吏都怕违法，拿着俸禄，却不敢干事情。他还居功自傲、不纳忠言，臣下都以阿谀奉承讨其欢心。
天下有方士三百，都是有才能的人。可是他们害怕受到迫害，都不敢讲真话。观星占卜发现吉凶，也不敢说出来。嬴政权力欲极强，每天批阅的奏简文书，数以石计，不分昼夜。像这种贪恋权势的人，观能之士岂能为他求长生不老之药。
由于卢生等人煽动，各地渐息的风潮又有抬头，告急的奏章不断送到始皇的御案上。当他看到卢生的檄文时，顿时大怒。当即急召朝中大臣和宗室，召开御前会议。
“朕急召众卿，是要与众卿商议一个重要而紧急的问题。前些日子，朕颁行《焚书令》，收缴了一批有害于天下安定的古籍，并付之一炬。朕还让各郡推荐一批贤良方正之士到咸阳，想让他们为大秦做点有益的事。还有些方士，要求为朕寻求仙药或炼丹制造长生不老之药，朕对他们也不错。”
“可是，推荐的那些儒生不但非议朝政，还挟众威胁朕，简直目无王法，目中无朕。而那些方士被朕识破骗术后，逃入江湖，更是肆意恶毒诽谤诋毁朕躬。”
“朕对于这些儒生可谓一忍再忍，仁至义尽，可是他们不但不知道感念君恩，反而变本加厉地攻击朕和朝廷。也许，他们以为朕的忍让是软弱可欺的表现。朕今天就是让他们看看朕强硬的一面，让他们见识见识天子之怒。”
始皇是第一次在众臣面前公开谈论方士和求神炼丹的事，言语之间透出阵阵杀气。众臣一听，始皇紧急召见，就是为这件事，都感到要有一场暴风雨来临。果然，始皇突然喊道：“蒙毅！”
蒙毅正在猜测皇帝所为，闻听慌忙曲身上前，施礼应道：“臣在！”
“上次抵制《焚书令》风潮抓捕的案犯审结没有？”
“回禀陛下，已经审结，正要把重刑犯送往北地修筑长城。”“有多少儒生？”
“犯以古非今、煽动黔首的案犯有四百六十名。”蒙毅如数家珍地回答道。
始皇冷笑道：“这四百六十名案犯不必送去修长城了。”蒙毅不解，问：“陛下有新的旨意？”
“不错，朕的旨意就是全数‘坑杀’。”
“啊……”众臣全呆住了，都为始皇这个意外的决定大吃一惊，蒙毅忙进言道：“陛下，万万不可，这些人……”
“别说了，任何人敢劝阻朕，与案犯同罪。”始皇面色铁青，不容置疑，显然是早已下了决心。蒙毅话到嘴边只得咽回去。其他大臣一见这种情形，谁也不敢多嘴了。
始皇正要宣布散会，忽然公子扶苏站起来屈身施礼，劝谏说：“父皇，千万不可。如今天下初定，这些儒生都是各郡的舆论之首，坑杀他们会引起天下不安。”始皇怒斥道：“朕已说过，任何人不得劝谏。你没有听见？”
“儿臣不劝谏，可是儿臣可以请父王听听脚下大地震动的声音吗？”“你这是危言耸听！”
“儿臣不敢，儿臣出巡齐鲁，亲眼所见民不聊生，赋税、徭役、酷刑逼得黔首没有生路，如果父皇坑杀儒生，势必引发更大的风暴。”
始皇怒不可遏。
