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在卡斯蒂利亚和阿拉贡，庆祝活动和斗牛比赛接连举行，民众在街头欢呼。
卡斯蒂利亚是这场战争的主要受益者，因为它不仅花费了远远超过其他地区的资金和人力来进行战争，还彻底吞并了格拉纳达。
为战争提供资金的任务非常艰巨，总费用估计为4.5亿马拉维迪（maravedies）。
格拉纳达的征服对阿拉贡的战略地位几乎没有影响，但它确实帮助巩固了卡斯蒂利亚在意大利和法国的支持，这正是阿拉贡的利益所在。
对于基督教世界来说，格拉纳达从伊斯兰统治中解放出来被视为对四十年前君士坦丁堡（constantinople）失守于奥斯曼人的一个平衡。
考虑到格拉纳达人几乎没有任何谈判的筹码，格拉纳达投降的条款对穆斯林来说相当慷慨。
这些条款类似于战争初期那些尚不确定结果的城镇投降时的条件。
三年内，穆斯林可以自由迁徙和返回。
他们被允许保留武器，但不得持有火器，不过这个条款在一个月后就被废除了。
任何人都不会被强迫改变宗教信仰，甚至那些已经皈依伊斯兰教的前基督徒也不例外。
博阿卜迪尔被提供金钱和在阿尔普哈拉斯山脉的一个小公国的统治权，尽管这一地区本来也难以控制。
最初，大部分被征服的格拉纳达得到了相对尊重，因此在七年内基本保持了稳定，尽管1492年的《阿尔罕布拉法令》（Alhambra decree）驱逐了那些未皈依的犹太人。
国王博阿卜迪尔很快发现他的处境无法忍受。
1493年10月，他离开领地前往摩洛哥，大约四十年后在那里去世。
最终，卡斯蒂利亚开始撤销条约中的一些较为宽容的条款。
这一行动由大主教希斯内罗斯（Archbishop cisneros）主导，他下令进行大规模皈依，焚烧了许多有价值的阿拉伯文献，推行其他对穆斯林（和犹太人）不利的措施。
这些举措引发了一场叛乱，最终许多穆斯林被迫在受洗、流放或处决之间做出选择。
从那时起，紧张局势持续加剧，卡斯蒂利亚不得不在格拉纳达维持一支庞大的军队以防止未来的叛乱。
伊莎贝拉加强了西班牙宗教裁判所的权力，费迪南德则将宗教裁判所引入此前未受其控制的阿拉贡。
