炎黄军战舰见南明战船逃跑，尾随跟上追击，南明的战船船小灵活，加上熟悉地形，很快钻入水道，在里面七拐八拐的将战舰甩开。
一艘炎黄军战舰追的太前，突然砰的一声，撞到了水面下的礁石，海水汹涌的流入战舰被礁石撞开的裂口中，幸好这艘战舰没有乘坐士兵，没有造成伤亡。
指挥战舰追击的黄云下令所有战舰停止追敌，随后他乘坐小船来到陈平的旗舰，
“大帅，方才我军追击敌船，敌船钻入水道引诱我军，水道内情况复杂，已经有一艘战舰撞到礁石，末将请大帅指示是否需要继续追击？”
陈平掏出单筒望远镜，对着前方水道仔细观察了一番，
“水道中的情况确实复杂，不必追击，以免我军遭受不必要的损失。”
“那舟山群岛我们就放弃了？”
黄云疑惑道。
“谁说要放弃了，他们逃他们的，我们打我们的，不要被敌人牵着鼻子走，水道里面进不去，我们就从外围岛屿登陆，将所有水道出口堵住，看他们能熬几天！”
“此乃妙计，大帅英明！”
黄云顺势拍了个马屁。
陈平也有点得意洋洋，自从统御升级到中级以后，感觉自己的脑瓜子都好用不少。
随后炎黄军上千战舰分成五十艘一队，分为二十队，堵住水道的出口，然后运输船靠岸在舟山群岛的外围岛屿登陆。
炎黄军将最大的几个岛屿占据，陈平又令农民在所占岛屿靠近水道一边的岸上建造炮塔，将水道封锁。
在炮塔的掩护下，炎黄军放下小船，让士兵乘坐小船划到水道对面的岛屿登陆，将对面岛屿占领，之后又派农民登岛，建造炮塔封锁水道。
就这样一步步推进之下，南明军在水道中的空间越来越狭窄，二张没想到炎黄军居然会用这种无耻的战法，不进入水道跟他们作战，而是逐渐推进压缩他们的生存空间。
期间他们也想冲出水道发起反击，可很快被炎黄军战舰连绵不绝的火焰巨弩给打退，还有不少战船被炎黄军的炮舰给击沉。
退回水道之后，二张清点战船发现只剩下七八十艘了。
二张又想派兵登陆水道附近的岛屿，将炎黄军在岛屿上的士兵消灭，抢回水道控制权，可惜还没靠近岛屿就被岛上的炮塔攻击，击沉击伤了二三十艘战船。
之后他们又尝试从炮塔够不到的地方登陆，这些位置往往崎岖狭窄，不适合大规模登陆，一次只能登上去几十人，被守在岛上的炎黄军一阵弓弩枪炮齐射给全歼了。
最后南明军的活动区域越来越小，被包围在一处小岛附近，陈平派人向他们喊话，让南明士兵投降。
听到炎黄军劝降的声音，不少南明士兵开着战船，打着白旗从水道中出来投降。
黄云指挥战舰围了过去，派士兵登船缴了南明军的武器，将他们集中看押在附近的一座岛屿上。
张明振和张煌言二人见大势已去，身后愿意跟随他们的南明军战船只有二三十艘了。
“侯服兄，看来明年今日就是我等的忌日了！”
“玄着，你怕不怕？”
“今日唯死而已，也算我等为大明尽最后一份力了。”
说罢二人相视大笑。
随后二人率领最后二十多艘战船，冲出水道，被外面堵住水道的炎黄军战舰全部击中，所有南明战船都燃起了大火，很多南明士兵跳到水中，向二张喊话，
“将军，快跳船！”
二张不肯跳船逃生，随着船上熊熊烈火一起沉入海底。
随后炎黄军派出运输船将落水南明士兵打捞上来。
此战全歼舟山水师共一百八十二艘战船，击沉一百二十多艘，俘虏五十多艘，杀死南明军四千多人，俘虏五千多人，其余失踪下落不明。
炎黄军只损失战舰十来艘，士兵百余人，多是舟山水师登岛作战反击所致。
歼灭舟山水师以后，炎黄军留一万人和50艘船驻守，向西进入杭州湾。
陈平船队在杭州湾的嘉兴海盐县登陆靠岸，六十多万大军在海盐县登陆就花了三天时间，又休整一日，才再次出发向杭州进军。
杭州城内，得知炎黄军前来攻打的消息，鲁王朱以海早就惊得六神无主，急忙寻来张国维、钱肃乐、李长祥三人询问对策。
“如今炎黄军来势汹汹，舟山水师全军覆没，我们该如何应对？”
朱以海询问道。
