赵构获得士族的支持后，马上采取了行动，他下旨招几个参加屠杀的高级将领到临安来自辩。他叫的几个人，都是跟秦桧关系密切的。那几个人觉得有秦相在，他们也是奉命行事，没有问题，不过为了安全起见，他们还是多带了一些护卫，然后就大摇大摆来到临安城了。
他们进临安城的时候，并没有人管，这让他们更加放心。而护卫们现在都分到了一些劫掠得来的钱，很想在临安好好玩玩，很快都跑的满城都是。
那几个将领被皇帝召见，一进宫门就被抓了起来。接着赵构下令关闭城门，在临安城里搜捕这次来的西军。
与此同时，赵构调动其他军队，还有一些世家控制的武装包围了参与屠杀的西军，解除了武装。但赵构为了防止江南士族趁机把西军一窝端，非常鸡贼以防止兵变为名，提出只诛首恶不计协从，只抓了一些高级军官，还趁机清洗了不听话的一些西军将领。
至于中下级军官和士兵，赵构亲自去安抚，所到之处西军全部跪倒，都高呼：“官家万岁！皇上圣明！”他成功利用这次事件清洗了秦派将领，重新掌握了大部分西军。
秦桧万万没有想到最后会发展成这样，他千算万算也没有算到西军会如此暴虐引起了公愤，而范浚陆游等人成功地利用他和官家的矛盾，将士族的矛头引向他。忧急之下，他病倒了，比原来的历史上提前了接近半年。赵构趁机收回了很多权利，现在暂时既当皇帝又当宰相。
完全控制京城后，赵构宣布为了体恤老臣，他将亲自去秦桧家探视病情。在此之前出动了很多军队，士兵从皇宫一直排到相府，秦府的家丁全都缴械被赶到一旁。秦熺带着一家老小在门口等了两个多时辰，赵构才姗姗来迟。
然后他宣布，皇恩浩荡，加封秦桧为建康郡王。秦桧自然要谢恩，于是有人把他从床上拖下来，放到赵构面前，行跪拜大礼，然后舞蹈谢恩。赵构又宣布秦桧应该游街夸官亮职。太监们给秦桧抬胳膊搬腿，穿上王袍，拽到马上，打起仪仗，到御街转了一圈。一番折腾之后，秦桧已经进的气不如出的多了。
然后赵构又让已经上气不接下气的秦桧坐在自己面前，语重心长地对秦桧说，很多人说秦桧是金国间谍，他是从来都不相信的；还有人说秦桧贪污腐败专用拍马溜须之辈，他也是坚决不相信的；还有人说秦桧有操莽之心，他更是坚决不相信的。
眼看秦桧坐不住要半躺在太师椅上，赵构一把拉着他的手，让他坐直，大讲三十年君臣之谊。说到动情处，影帝赵构眼泪都下来了。而影相秦桧由于身体和精神的原因，完全不在状态，“无一语，只流泪而已。”
即便如此，秦熺还不服输，不甘心放弃宰相梦，派秦埙同亲信林一飞、郑木冉见台谏官徐喜、张扶，并联络熟悉的将领，策划自己的拜相事宜。但还没来得及行动，已经回宫的赵构又在朝堂上宣布进秦熺为少师，为了让老太师秦桧养病，让秦熺侍奉床前尽孝心，恩准他爷俩都退休致仕。满朝文武都称颂官家对秦家父子皇恩浩荡，秦熺孝感天地，无一人提出异议。秦氏父子这才死了心。
当晚经不起精神和肉体折磨的秦桧就死了。原本历史上他还可以多活半年，高王二人穿越的小蝴蝶翅膀扇动带来的改变，让他提前死了。赵构假惺惺的追赠他为申王，谥号忠献。这种不花钱，没实权的称号，赵构还是愿意给的。他只不过觉得秦桧当政二十年，门生故吏众多，树大根深，要铲除还需要慢慢来。
至于王高谋反案，查无实据。吴益和王继先找人控告王文修王忠义为赖账杀死王七六一家六口。大理寺一开始还没体会到秦桧已死，秦家已经倒台，就判王忠义贪匿货款，欺骗王文修，大辟。王文修被蒙蔽，罚银三千两。
但赵构抓住不放，他早就对王文修他父亲和叔叔都投降金国非常不满，而且要让世人都知道秦家完了，一定要拿王文修开刀。但鉴于王文修有散官的官职，根据宋朝不杀士大夫的原则，最后定了一个王文修纵奴行凶事后隐匿，诬告他人谋反，夺人财产， 将其发配岭南。
最后给王有志定的罪名是骄横不法，与民争利。这个罪名有点滑稽，因为阜康商号本来就是民，王有志也不算正经官员。虽然罪名荒唐，但通缉令被取消了，罚没全部家产。高全的罪名居然是擅离职守，看来官家认为他是个头脑简单的武将，可以争取。
不过有意思的是，他俩的官职却保留了下来。这是吴益争取来的，自从王有志走后，吴益的公务再无寸进。他非常想念王有志在的时候，他不但天天有进项，还月月有政绩
