由于在合并前，两个军事部门中的官员全部都是文官，没有武将，而且这些文官全部都是不懂军事，严重影响了东宋军队战斗力的提升和发挥。于是，段智鸣把合并到一起的军事部门中所有负责带兵打仗但又不懂得军事的文官全部都换成了拥有丰富的军事作战经验和良好才能的武将。当然了，像一些特殊的职位，但又不会影响武将带兵打仗，段智鸣则还是让文官继续担任。毕竟这些特殊的职位，武将根本就担任不了，只有文官才能担任。
另外，东宋从立国开始到现在执行了这么长时间的重文轻武的国策，不但严重限制了军队战斗力的提升，同时还让东宋上下瞧不起军人，使得那些要为官的人只愿意去当文官，而不愿意去当武将。从而让那些有着非常好的军事才能的人为了自己的前途，都不愿意进入军队，让军队失去了很多军事人才。
为了给东宋的军队充实军事人才，进一步提升军队的战斗力。段智鸣又下令，组建军事学院，并从军队中挑选一些有着丰富的作战经验的武将进入组建的学院里担任教员，来为东宋的军队培养军事人才。
在封建社会中，军队根本就没有专门培养军事人才的学院，只能在作战过程中慢慢的发掘人才。历朝历代都是这样，从而使得军队无法拥有自己所需要的军事人才，这也是封建社会的军队比不上现代社会军队的原因之一。
段智鸣组建军事学院的事情一公布，整个东宋就炸开了锅。毕竟东宋所有的人都没有想到，段智鸣居然要组建一个专门培养军事人才的学校。他们都认为段智鸣设立这种培养军事人才的学校，完全就像小孩玩过家家一样。尤其是武将，他们认为打仗不同于念书。在战场上，什么样的情况都是有可能发生的，所以对军人的要求是要机智灵活，要杀伐果断。而不是墨守成规，犹犹豫豫的。并且从军事学院里面出来的军人因为在学院里面读了太多的书，书生气太重，不管做什么事情都会墨守成规、犹犹豫豫，不能杀伐果断和机智灵活，已经失去了做为一个军人的基本条件。要是让从军事学院里面出来的人进入军队来带兵打仗的话，只怕会降低军队的战斗力，让军队在战场上全军覆没。
于是，朝堂中所有的人，纷纷上书请求段智鸣收回设立军事学院的旨意。
但段智鸣没有同意，他对那些反对自己设立军事学院的人说道：“既然你们认为组建培养军事人才的学堂不但无法提升军队的战斗力，相反还会降低军队的战斗力，那我们就让事实来说话；如果这些从学堂里面出来的人可以增强军队的战斗力，那么你们以后就不许在说什么裁撤培养军事人才学堂的事情；要是这些从学堂里出来的人不能增强军队的战斗力，相反还会降低军队的战斗力，那朕二话不说，立马把这个专门培养军事人才的学堂裁撤掉。”
此话一出，那些反对段智鸣组建军事学院的人也就没有在说什么了。因为事实胜于雄辩，到时候不管事实是什么样，都不会再有人为此争论不休了。
其实段智鸣设立军事学院还有一个原因，就是要让军队中的那些武将能够文武双全。因为封建社会的军队中，上至将帅，下至士兵，绝大部分人都是没有文化的，或者是文化不高的人。这一点对于军队来说是非常致命的。要知道，一个军人，尤其是带兵打仗的将帅，如果没文化，那他就不能提高军队的战斗力，甚至在战场发生不利的情况时，也就无法将其解决。
另外，因为东宋重文轻武的国策，使得军人的地位非常的低，不但军队的士气不怎么高涨，就连招兵的工作也受到了很大的影响。虽然段智鸣已经废除了那些重文轻武的国策，但这样的现象却没有始终根除。为此，段智鸣决定和三法司、兵部以及东宋军队中的高级将领召开会议，制定一些列保护军人利益的法律法规和加强对军队正面的宣传。用以提高军人在东宋的地位，加强军队的士气以及让招兵工作顺利开展。
段智鸣按照现代社会中的军事法律为基础，和三法司还有军队的高级将领制定了一系列符合东宋国情的军事法律，并派人对军队的荣誉大肆的宣传。这些保护军人的军事法律一出台，加上段智鸣对军队的宣传，使得军人在东宋的地位也陡然攀升，所有的人都改变了对军人的看法，不在歧视军人以及认为军人是很低下的，他们对军人产生了敬畏之心还有尊敬。同时，招兵工作也因此顺利的开展，好多原来不愿意当兵的人都开始踊跃的报名参军。
差不多过了五六个月，段智鸣把东宋除禁军外的所有军事部门全部都改革了一番，使得东宋所有的军队焕然一新，战斗力也慢
