意志与灵魂的成长来带动提升，没有种子的人不能成为忍者，这就是有秘术忍族与血继忍族、忍族与普通忍者有区别的原因。
而且查克拉由于寄生扎根于灵魂与肉体的深处，或者说共生所以可以直接用查克拉交流，如尾兽的会议空间，并且由于共生的原因，可以以此为联系无视距离的交流，放下心房的人们可以由查克拉进行互联网式的交流。
查克拉也可直接强化于自身肉体进行瞬身，进行怪力增幅，极致形态变化如螺旋丸，就是用大量的无序查克拉围绕有序核心进行高速运动来造成大量伤害，虽说是模仿自尾兽玉。
总得来说查克拉是神树种子的能量，结出的查克拉果实，属于大筒木一族的能量体系。秦幸博对查克拉和神树的关系有着深刻的理解。查克拉是由神树转化自然能量而成的，而神树是转换器，吸取星球上各种的能量然后转化成查克拉。这种适合大筒木使用的能量，不知道是算提纯还是分解转化，忍者的查克拉就是劣化的。
秦幸博认为，大筒木一族并没有自主变强的手段，全靠吞食查克拉丹药、神树果实进行升级（能量的剧集），完全就是自然能量和星球能量的寄生虫，却没有直接消耗恒星高效，对于一种星际族群来说，这种能量利用似乎过于低效了。
再说大筒木那一群几乎是依托于查克拉的半信息生命了，根本和忍者就不是一种生命形态，而且，大筒木一族虽然不怕查克拉的能量攻击，却不能吸收大自然本身的能量攻击（如真实的火、风、雷电乃至土）、物理攻击，给人一种并非是查克拉的创造者，而是查克拉神术科技的使用者。
可以说，在关于查克拉的原理研究上，半土着的大筒木羽衣可能比前来忍界的诸多大筒木有更高的科学素养。就连博人传中的大筒木一式，一个真正活着的大筒木居然还要依靠阿玛多来推动科技？
：()目标：逃离忍界
