集中精力改变基因能量波动就能干扰机械生物的程序。林宇趁机率领众人发动总攻，最终将机械生物全部消灭。从此，他们守护的世界真正迎来了长久的和平，一家人过上了安宁美满的生活。
几年过去了，林宇和苏瑶的孩子渐渐长大。一天夜里，孩子突然惊醒，跑到父母房间惊恐地说梦到了可怕的黑暗力量。林宇和苏瑶安抚好孩子后，却隐隐有种不安感。
第二天，天空莫名变得昏暗，远方出现一团团黑色雾气向城市蔓延。雾气所到之处，植物枯萎，建筑腐蚀。林宇和苏瑶意识到新的威胁来临。
他们来到城市边缘查看，苏瑶试图用基因能量驱散黑雾，可是毫无作用。林宇发射信号弹召集曾经一起战斗的伙伴。大家汇聚在一起商讨对策，有人提到古籍中曾暗示过有一种净化之力可以对抗黑暗力量。
苏瑶沉思片刻后，决定冒险一试。她调动全身基因能量，进入一种空灵状态去探寻净化之力。就在黑雾即将吞噬整个城市之时，苏瑶周身爆发出强烈的白光，这股光冲向黑雾。林宇带着人们大声呼喊给苏瑶加油。最终，白光彻底驱散黑雾，城市恢复生机。经此一役，世界再无大灾大难，林宇一家也一直幸福地生活下去。
