第61师接受任务后，积极地筹集船只，训练水手，进行航海登陆的训练和演习。
1949年10月18日，第61师命第183团并加强第182团第1营向桃花岛发起攻击。桃花岛守敌为蒋匪交警第9纵队和国民党青年军第89军第231师第662团第3营，共约4个营的兵力。18时40分，在我炮击的同时，第183团各营和第182团第1营分别起渡，利用海雾夜暗，向桃花岛前进。
在距敌约80米时，被敌发现，战斗打响，经13分钟的激战，我各船队陆续突破敌前沿阵地。
继而分割穿插，夺取要点，战斗发展顺利。
至次日天亮时，已切断了敌退路，肃清了残敌，控制了所有渡口，击退了敌人增援。守岛之敌1300余人被我全歼。
桃花岛战斗的胜利，为解放舟山群岛创造了条件，获得了第7兵团的高度评价，说此次战斗是“抓紧战机，大胆突击，以迅速果敢的动作，实行插断为获取胜利的典范”。
血战登步岛
1949年11月3日，第61师奉命对登步岛发起攻击战斗。登步岛守敌为敌第221师第661团及第662团第1营，第221师师长坐阵指挥。
我第一线部队第181团第3营和第4连、第183团第1营晚8时起渡，在炮火掩护下，陆续突破敌防御，顺利登陆，并在拂晓前将敌主力打退，抢占了流水岩、野猪塘山、炮台山等制高点。
但因我渡海工具落后，后续部队接济不上，登陆部队兵力太单薄，当夜未能将守敌全歼并控制渡口，而敌人于4日晨有2个团在飞机掩护下增援，我登陆的7个连队英勇抗敌反击，战斗打得十分激烈。
第182团第4连第3班长秦玉芝身负重伤，还爬上了山头，继续战斗；该团第7连连续打退敌人1个团的5次集团冲锋；第183团第1营在流水岩连续打退敌人数10次的反扑，子弹打完了，就用石头，使敌人始终上不来。
这样对峙了一天一夜。
5日天亮后，敌人援兵增至6个团。敌人以绝对优势兵力，在数艇军舰、七八架飞机的掩护下，向我不断反击，我又与敌血战一天，伤亡甚重，有的连只剩下十几个人。于是，我主动撤出战斗，于5日半夜12点撤回桃花岛。在撤退时，第1连战士付祥明失去联系，在敌人追赶时，他跳进大海，后被海浪冲到一个无名岛上，坚持10日，被第182团水手队救回归队，该同志被评为华东2级人民英雄，他的事迹曾被编成戏演出，《人民文学》还发表了以他的事迹为基础的小说。
登步岛战斗后，蒋介石又调整部署，增防一个军，并有美日顾问协助，增设雷达、爆破筒等海防设施。鉴于我攻占登步岛条件尚不具备，野指命我加紧准备，待条件成熟再行攻击。在总攻舟山群岛的备战练兵期间，还发生了一件木船打兵舰的事。
12月18日，第181团第2营水手队奉命以6只木船，由桃花岛去穿山半岛执行接运任务。
途中与敌5艘巡逻炮艇遭遇，我9号船为掩护其余船只安全转移，主动落蓬牵制敌人。
敌见我落蓬，便以一艘炮舰高速向我驶来。我9号船长任少乐将船上11名同志分成两个小组，准备近战歼敌。敌舰靠近时，便狂叫“抓活的”！此时，船长一声“打！”我机枪、战防枪一齐向敌猛射，手榴弹、炸药包和石灰炸药包一齐投向敌舰。由于我木船紧靠敌高大炮舰，敌炮火不能发挥作用，遭我沉重打击后，掉头鼠窜。我9号木船安全追上船队。
在备战练兵期间，第61师于1950年4月上旬在桃花岛召开了第二次党代会，到会代表400余人，历时一周。
师党委书记胡炜同志作了渡海作战以来的工作报告，师党委副书记叶扬同志作了总结。这次会议对进攻舟山群岛的战备工作形势进行了分析，明确了训练的重点是渡海攻坚和连续突击，使战前训练落到了实处。5月13日，在我各项准备工作即将完成时，舟山群岛守敌慑于被歼，弃岛向台湾逃窜。当我查明情况，发起渡海追击时，敌已全部逃跑。19日，第61师和兄弟部队一起在追击敌人中占领了舟山群岛。从此，国民党军对长江口的封锁即被我打破。
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入朝参战
1952年底，第61师奉命解除浙江海防任务，作入朝参战准备。
1953年3月1日，第61师在昆山火车站登车，经4昼夜车运到达吉林省通化市。
