仙门全力推行人才培养创新模式，虽已初见成效，然在实践过程中，诸多棘手问题亦接踵而至，亟待解决。
首当其冲者，乃个性化培养引发的资源分配不均。诚如先前所言，为契合弟子天赋专长而定制的修炼计划，需投入形形色色的珍稀资源，如独特草药、奇异矿石、古老符文典籍等。门派资源库虽底蕴深厚，然面对众弟子差异化的需求，难免捉襟见肘。
以炼丹师为例，部分专注于高阶丹药炼制的弟子，需耗费大量如千年灵芝、万年雪莲等稀世草药。此类草药生长于险峰绝地，采摘不易，存量有限。而门派中研习基础丹药炼制之弟子，亦需一定数量的普通草药以夯筑根基。资源分配评估小组虽竭力权衡，然争议之声仍不绝于耳。
有研习特殊丹药的弟子抱怨：“吾等致力于突破高阶丹药炼制之瓶颈，此乃关乎门派声誉与实力之举。若缺乏关键草药，一切努力皆将付诸东流，奈何所获资源寥寥无几。”而基础炼丹弟子亦有微词：“吾辈虽仅修炼基础丹药，然亦为门派丹药供应之基石。若无充足草药以供练习，技艺难以精进，门派日常所需丹药恐难以为继。”
阵法师那边，情况亦颇为棘手。擅长大型防御阵法的弟子，请求调配巨型灵晶以强化阵法威力，此等灵晶体积硕大、灵力雄浑，且来源稀缺。而主攻小型辅助阵法的弟子，则急需大量精致的阵旗与灵纹石，这些材料虽单个价值不及巨型灵晶，然用量颇大。负责资源管理的执事为此大伤脑筋，苦叹道：“阵法师所需材料种类繁杂，且彼此难以替代，欲在有限资源内满足各方需求，实乃难如登天。”
炼器师同样面临困境。精于炼制攻击性法宝的弟子，渴望得到蕴含强大攻击性灵力的雷炎晶与玄铁精金，此二者价格高昂且市场难觅。而专注于防御性法宝炼制的弟子，则对能够吸纳和转化攻击力量的灵龟甲、星纹钢需求甚殷。资源分配一旦失衡，极易引发弟子间的不满与矛盾。
再者，跨领域融合培养导致部分弟子精力分散，顾此失彼。阵法师学习炼丹师的灵力感知技巧时，因二者修炼体系与思维模式大相径庭，阵法师需耗费大量时间与精力去适应。有阵法师弟子诉苦：“吾本专注于阵法布局与灵力引导，今为习得炼丹师的感知之法，日夜苦思冥想，反致阵法修炼停滞不前。阵法之道在于宏观布局与灵力流转的精妙掌控，而炼丹感知侧重于微观灵力波动的洞察，二者实难兼顾。”
炼丹师学习炼器师的符文铭刻原理亦遇阻碍。符文铭刻需精准的灵力操控与对金属特性的深刻理解，炼丹师习惯了草药灵力的温和驾驭，面对炼器符文的刚猛灵力与金属的坚硬质地，往往难以得心应手。某炼丹师弟子无奈道：“吾尝试将符文铭刻之法融入炼丹过程，然操作时屡屡失误。符文铭刻要求灵力如刀刻斧凿般精准有力，而炼丹时灵力的运用则如春风化雨般轻柔细腻，转换之间，困难重重。”
炼器师学习阵法师的灵力阵法构建时，亦觉力不从心。阵法构建涉及复杂的空间灵力架构与多元灵力的协同运作，炼器师擅长的是在有限空间内打造法宝的灵力回路。一炼器师弟子坦言：“吾欲将阵法之妙融入法宝炼制，使法宝兼具阵法之威。然阵法的空间灵力布局浩瀚复杂，远超法宝内部的灵力回路设计，吾常深陷其中，迷失方向，致使法宝炼制进度迟缓。”
此外，创新模式对长老的教学能力亦提出了严峻挑战。长老们多精于本领域知识与技能，然跨领域教学时，自身知识储备与教学经验的局限性尽显。
负责阵法师教学的长老在传授炼丹师感知技巧时，因缺乏深入的炼丹实践经验，仅能照本宣科，难以解答弟子在实际修炼中遇到的疑难问题。弟子们困惑不解，长老亦觉颜面无光，喟叹道：“吾虽对阵法了如指掌，然炼丹之道于吾而言，终究隔行如隔山。欲引导弟子融会贯通，却深感力不从心。”
炼丹长老在教导炼器师符文铭刻时，因对炼器工具与金属特性知之甚少，无法进行生动形象的演示与深入浅出的讲解。弟子们似懂非懂，教学效果差强人意。炼丹长老无奈摇头：“符文铭刻于金属之上，与炼丹时符文绘于丹鼎之内，二者差异悬殊。吾空有满腹炼丹经纶，却难以在炼器教学中施展拳脚。”
炼器长老在指导阵法师灵力阵法时，因对大型阵法的实战运用缺乏切身体会，无法传授给弟子在复杂战斗环境下阵法灵活应变的精髓。弟子们虽努力学习，然在实战模拟中仍破绽百出。炼器长老忧心忡忡：“阵法的实战运用瞬息万变，吾在这方面的短板，恐误人子弟，影响弟子们在跨领域学习
