滚打多年，深知此案已经惊动了朝廷，自己绝无生还的可能。于是，他决心以死谢罪。
在进入大牢之前，王毂偷偷携带了一面玻璃小镜子。在刑部审讯的间隙，他猛地砸碎镜子，用锋利的碎片划向自己的腹部，鲜血顿时染红了衣衫。然而，这一刀并未致命。王毂一心求死，又狠心地划破了颈部的血脉。幸好狱卒及时发现，将他从死神手中抢救回来。
经历这番折磨后，王毂的精神彻底崩溃。他不再抱有任何幻想，将自己贪污、受贿，以及协助王伸汉掩盖杀人真相的罪行一一交代清楚。这起震惊朝野的李毓昌案，终于随着两位罪魁祸首的招供，逐渐揭开了它神秘的面纱。
李毓昌案终于真相大白，犹如一道惊雷，在朝野间引起了轩然大波。嘉庆皇帝在接到刑部详尽的报告后，心中震惊不已，他喃喃自语道：“江南之地，竟藏着如此离奇之案，可见吏治败坏已至极点。”
愤怒之下，嘉庆皇帝对江苏各级官员展开了猛烈的抨击。他痛斥道：“你们这些督抚大员，竟然对此毫无觉察！朕用人不明，误用了你们这群败类，这确实是朕的过错。但你们，又有何颜面去面对天子，去面对万民？每当地方遭遇灾害，那些不肖的州县官员便趁机捏造灾情，侵吞赈灾款项，中饱私囊。而那些负责查赈的委员，更是与他们狼狈为奸，贪图分润。这简直是在向饥寒交迫的灾民夺口食，毫无人性可言！更令朕震惊的是，山阳县在查办赈务时，竟因委员秉持公正，不肯同流合污，就遭到灭口之祸，这简直是闻所未闻！”
为了彻底整顿官场，嘉庆皇帝下令展开一场规模空前的大追责、大查办行动。他首先颁发圣旨，命令两江总督铁保和江苏巡抚汪日章自行议罪，即让他们自己给自己定罪。同时，他还摘去了汪日章的顶戴，以示惩罚。
就在这时，两江总督铁保却自投罗网。原本与李毓昌案关系不大的他，因未能认清形势，成了这场严厉惩处中的第一个牺牲品。
在京城深处，涉案的罪犯已经低头认罪，然而远在千里之外的两江总督铁保，却对刑部审讯的进展一无所知。他糊涂地呈上一份奏折，言辞中满是不解：“此案尚无确凿线索，尚需深入调查。”他还提出了几个疑问，似乎在为李毓昌案辩护，表达自己对这起案子的疑惑。
铁保身为两朝元老，封疆大吏，资历深厚，本与李毓昌案无甚瓜葛，只需承担领导失察之责。然而，他的这份奏折却透露出对江苏官员的庇护之意，且未能抓住案件的关键，暴露出他平日里的漫不经心与懒散作风。
这份不合时宜的奏折，如同一块投入平静湖面的石头，激起了嘉庆皇帝的怒火。他看过奏折后，心中怒火中烧：“有此等糊涂总督，江南官场岂能不腐败成风！”
于是，嘉庆皇帝决定拿铁保开刀，以儆效尤。他颁布了一道圣旨，毫不留情地痛斥铁保：“你糊涂至极，自上任以来，办事懈怠，玩忽职守。治河则河工颓败，治吏则吏治松弛。你竟纵容下属藐视法纪，贪婪残忍，而你自己却醉生梦死，实不堪封疆重任。现革去你的职务，发配至乌鲁木齐效力赎罪。”
就这样，铁保这位曾经权倾一时的封疆大吏，因一份糊涂的奏折而黯然失色，被无情地推出了政治舞台。
铁保的悲惨命运，预示着李毓昌案绝不会草草了结。嘉庆皇帝震怒之下，对江苏省的其他官员也进行了严厉的处置。
他狠狠地斥责江苏巡抚汪日章道：“你身为巡抚，管辖之下竟发生如此惊天大案，你却一无所知，简直如同聋子瞎子一般。你虽然没有铁保那般固执谬见，但也已经年老无能，无法胜任巡抚之职。现命你革职回籍，好好反省去吧。”
江宁布政使杨护，本是负责救灾办赈的要职，然而他非但未能查出王伸汉冒领赈银的罪行，就连查赈官员被害也一无所知。他的罪责比巡抚还要重得多。嘉庆皇帝愤怒之下，本应将他革职查办，但念及他平日还算尽心尽力，便下令将他降级留用，发配到河工系统戴罪立功。
而江宁按察使胡克家，对现任官员离奇暴毙的重案，竟然没有进行详细复核查验就草率结案，这无疑是严重的渎职行为。嘉庆皇帝愤怒之下，将他降职留用，并命他在河工系统效力，以观后效。
一场官场风暴席卷而来，李毓昌案终于迎来了正义的审判，而那些涉案的官员，也一一受到了应有的惩处。
经过深入调查，终于揭开了王伸汉的贪婪面目。他竟然侵吞了高达两万三千两的赈银，其中一万两银子被他用于四处打点关系，以求在官场中稳固自己的地位。
